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讲座主题： 2020版本新功能介绍
讲座时间：2020年3月6日（周五），下午14:00
主讲人：罗芳（产品9游会的技术支持，生命科学部门）
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分子动力学模拟
新增multi-site lambda dynamics method(msld)：用于计算大型类属库分子的相对结合自由能，更好地进行先导化合物的筛选优化；且可以用gpu计算；
图1：通过msld方法计算组合库中分子的相对结合自由能
新增显式膜结构的跨膜蛋白的分子动力学计算。提供多种类型的磷脂膜结构，同时支持自定义膜类型。
图2：在popc显式膜内溶剂化的herg离子通道
抗体理性设计
新增计算抗体黏度，蛋白溶解度；
优化predict humanizing mutations protocol（抗体人源化计算）参数，可以同时自定义重链（h）和轻链（l）的v基因和j基因。
药效团
新增ensemble pharmacophore generation：从一组活性配体生成一组共同特征的药效团。活性配体使用2d指纹进行聚类。对于每个聚类，从聚类中心选择5个配体，然后使用共同特征药效团算法创建药效团；
新增interaction pharmacophore generationprotocol：从受体-配体复合物的非键相互作用出发产生药效团模型。
第三方程序的更新
charmm版本更新至c43b2
modeler版本更新至v9.22
dmol3版本更新至v2020
抗体模板库更新至2019年7月
与最新发布的biovia 2020相兼容
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